Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps29P62274 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps29P62274 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps29P62274 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps29P62274 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps29P62274 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps29P62274 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps29P62274 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps29P62274 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps29P62274 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms