Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SnnP61807 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnnP61807 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnnP61807 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnnP61807 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnnP61807 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnnP61807 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnnP61807 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnnP61807 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnnP61807 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnnP61807 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnnP61807 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnnP61807 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnnP61807 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnnP61807 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SnnP61807 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnnP61807 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnnP61807 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnnP61807 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnnP61807 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnnP61807 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnnP61807 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnnP61807 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnnP61807 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnnP61807 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnnP61807 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnnP61807 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnnP61807 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnnP61807 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SnnP61807 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SnnP61807 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnnP61807 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnnP61807 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnnP61807 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnnP61807 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnnP61807 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnnP61807 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnnP61807 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnnP61807 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnnP61807 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnnP61807 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnnP61807 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnnP61807 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnnP61807 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnnP61807 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnnP61807 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnnP61807 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnnP61807 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnnP61807 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnnP61807 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnnP61807 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnnP61807 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnnP61807 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnnP61807 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnnP61807 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnnP61807 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnnP61807 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnnP61807 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnnP61807 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnnP61807 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnnP61807 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnnP61807 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnnP61807 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnnP61807 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnnP61807 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms