Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abce1P61222 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abce1P61222 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abce1P61222 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abce1P61222 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abce1P61222 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abce1P61222 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abce1P61222 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms