Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ActbP60710 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ActbP60710 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ActbP60710 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ActbP60710 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ActbP60710 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ActbP60710 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ActbP60710 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ActbP60710 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ActbP60710 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ActbP60710 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ActbP60710 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ActbP60710 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ActbP60710 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ActbP60710 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ActbP60710 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ActbP60710 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ActbP60710 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ActbP60710 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ActbP60710 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ActbP60710 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ActbP60710 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ActbP60710 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ActbP60710 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ActbP60710 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ActbP60710 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ActbP60710 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ActbP60710 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ActbP60710 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ActbP60710 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ActbP60710 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ActbP60710 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ActbP60710 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ActbP60710 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ActbP60710 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ActbP60710 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ActbP60710 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ActbP60710 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ActbP60710 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ActbP60710 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ActbP60710 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ActbP60710 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ActbP60710 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ActbP60710 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ActbP60710 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ActbP60710 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ActbP60710 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ActbP60710 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ActbP60710 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ActbP60710 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms