Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b6P59708 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms