Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps33bP59016 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps33bP59016 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps33bP59016 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms