Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr8P58682 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr8P58682 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr8P58682 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr8P58682 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr8P58682 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr8P58682 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr8P58682 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms