Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdsp1P58466 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp1P58466 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms