Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dpf3P58269 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf3P58269 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms