Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtnsP57757 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtnsP57757 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CtnsP57757 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtnsP57757 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtnsP57757 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtnsP57757 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtnsP57757 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtnsP57757 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtnsP57757 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtnsP57757 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms