Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp2c39P56656 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp2c39P56656 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp2c39P56656 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms