Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd38P56528 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd38P56528 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd38P56528 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd38P56528 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd38P56528 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms