Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtskP55097 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtskP55097 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtskP55097 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CtskP55097 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtskP55097 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtskP55097 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtskP55097 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtskP55097 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtskP55097 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtskP55097 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtskP55097 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtskP55097 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtskP55097 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtskP55097 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtskP55097 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtskP55097 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtskP55097 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtskP55097 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtskP55097 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtskP55097 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtskP55097 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtskP55097 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtskP55097 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtskP55097 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtskP55097 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtskP55097 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtskP55097 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtskP55097 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtskP55097 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtskP55097 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtskP55097 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtskP55097 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtskP55097 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtskP55097 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CtskP55097 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtskP55097 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtskP55097 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtskP55097 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtskP55097 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtskP55097 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtskP55097 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtskP55097 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtskP55097 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CtskP55097 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtskP55097 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtskP55097 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtskP55097 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtskP55097 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtskP55097 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CtskP55097 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtskP55097 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtskP55097 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtskP55097 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtskP55097 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtskP55097 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtskP55097 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtskP55097 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtskP55097 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtskP55097 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtskP55097 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtskP55097 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtskP55097 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtskP55097 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CtskP55097 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtskP55097 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtskP55097 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CtskP55097 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CtskP55097 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtskP55097 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtskP55097 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtskP55097 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms