Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ephb3P54754 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ephb3P54754 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms