Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad23bP54728 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23bP54728 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms