Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XpcP51612 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XpcP51612 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XpcP51612 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XpcP51612 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XpcP51612 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XpcP51612 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
XpcP51612 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
XpcP51612 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
XpcP51612 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XpcP51612 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XpcP51612 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XpcP51612 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XpcP51612 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XpcP51612 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XpcP51612 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XpcP51612 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XpcP51612 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XpcP51612 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XpcP51612 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XpcP51612 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XpcP51612 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
XpcP51612 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XpcP51612 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XpcP51612 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XpcP51612 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XpcP51612 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XpcP51612 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XpcP51612 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XpcP51612 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XpcP51612 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XpcP51612 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XpcP51612 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XpcP51612 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XpcP51612 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XpcP51612 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
XpcP51612 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XpcP51612 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XpcP51612 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XpcP51612 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XpcP51612 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XpcP51612 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XpcP51612 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XpcP51612 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XpcP51612 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XpcP51612 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XpcP51612 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XpcP51612 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XpcP51612 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XpcP51612 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XpcP51612 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XpcP51612 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XpcP51612 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XpcP51612 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XpcP51612 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XpcP51612 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XpcP51612 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XpcP51612 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XpcP51612 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XpcP51612 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XpcP51612 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XpcP51612 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XpcP51612 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XpcP51612 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XpcP51612 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XpcP51612 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XpcP51612 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XpcP51612 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XpcP51612 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XpcP51612 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XpcP51612 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XpcP51612 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XpcP51612 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XpcP51612 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XpcP51612 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XpcP51612 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XpcP51612 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XpcP51612 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XpcP51612 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XpcP51612 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XpcP51612 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XpcP51612 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XpcP51612 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XpcP51612 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XpcP51612 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XpcP51612 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XpcP51612 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XpcP51612 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XpcP51612 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XpcP51612 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XpcP51612 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XpcP51612 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XpcP51612 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XpcP51612 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XpcP51612 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XpcP51612 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XpcP51612 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XpcP51612 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XpcP51612 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XpcP51612 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms