Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LtbrP50284 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LtbrP50284 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LtbrP50284 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LtbrP50284 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LtbrP50284 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LtbrP50284 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LtbrP50284 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LtbrP50284 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LtbrP50284 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms