Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cav1P49817 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cav1P49817 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cav1P49817 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cav1P49817 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cav1P49817 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cav1P49817 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cav1P49817 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cav1P49817 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cav1P49817 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cav1P49817 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cav1P49817 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms