Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5P49615 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5P49615 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms