Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GdnfP48540 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GdnfP48540 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GdnfP48540 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms