Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prox1P48437 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prox1P48437 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prox1P48437 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prox1P48437 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prox1P48437 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms