Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TgfaP48030 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TgfaP48030 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TgfaP48030 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TgfaP48030 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TgfaP48030 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TgfaP48030 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TgfaP48030 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TgfaP48030 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TgfaP48030 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TgfaP48030 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TgfaP48030 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms