Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms