Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ThpoP40226 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ThpoP40226 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ThpoP40226 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ThpoP40226 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ThpoP40226 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ThpoP40226 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ThpoP40226 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ThpoP40226 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ThpoP40226 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms