Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cap1P40124 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cap1P40124 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cap1P40124 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cap1P40124 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cap1P40124 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cap1P40124 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cap1P40124 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cap1P40124 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cap1P40124 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cap1P40124 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cap1P40124 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms