Protein–RNA interactions for Protein: P38649

Abo, Histo-blood group ABO system transferase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AboP38649 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AboP38649 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AboP38649 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AboP38649 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AboP38649 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AboP38649 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AboP38649 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AboP38649 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AboP38649 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AboP38649 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AboP38649 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AboP38649 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AboP38649 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AboP38649 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AboP38649 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AboP38649 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AboP38649 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AboP38649 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AboP38649 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AboP38649 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AboP38649 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AboP38649 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AboP38649 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AboP38649 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AboP38649 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AboP38649 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AboP38649 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AboP38649 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AboP38649 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AboP38649 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AboP38649 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AboP38649 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AboP38649 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AboP38649 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AboP38649 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AboP38649 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AboP38649 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AboP38649 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AboP38649 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AboP38649 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AboP38649 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AboP38649 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AboP38649 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AboP38649 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AboP38649 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AboP38649 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AboP38649 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AboP38649 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AboP38649 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AboP38649 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AboP38649 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AboP38649 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AboP38649 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AboP38649 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AboP38649 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AboP38649 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AboP38649 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AboP38649 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AboP38649 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AboP38649 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AboP38649 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AboP38649 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AboP38649 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AboP38649 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AboP38649 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AboP38649 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AboP38649 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AboP38649 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AboP38649 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AboP38649 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AboP38649 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AboP38649 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AboP38649 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AboP38649 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AboP38649 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AboP38649 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AboP38649 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AboP38649 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AboP38649 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AboP38649 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AboP38649 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AboP38649 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AboP38649 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AboP38649 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AboP38649 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AboP38649 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AboP38649 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AboP38649 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AboP38649 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms