Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PpargP37238 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpargP37238 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PpargP37238 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PpargP37238 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PpargP37238 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PpargP37238 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PpargP37238 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PpargP37238 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PpargP37238 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PpargP37238 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PpargP37238 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PpargP37238 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PpargP37238 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpargP37238 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpargP37238 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpargP37238 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpargP37238 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpargP37238 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpargP37238 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpargP37238 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpargP37238 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpargP37238 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpargP37238 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PpargP37238 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PpargP37238 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PpargP37238 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PpargP37238 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PpargP37238 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PpargP37238 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PpargP37238 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpargP37238 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PpargP37238 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpargP37238 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpargP37238 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpargP37238 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpargP37238 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpargP37238 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpargP37238 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpargP37238 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpargP37238 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpargP37238 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpargP37238 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PpargP37238 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PpargP37238 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PpargP37238 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PpargP37238 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PpargP37238 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PpargP37238 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PpargP37238 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PpargP37238 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PpargP37238 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PpargP37238 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PpargP37238 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PpargP37238 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PpargP37238 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PpargP37238 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PpargP37238 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PpargP37238 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PpargP37238 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PpargP37238 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PpargP37238 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PpargP37238 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PpargP37238 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PpargP37238 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms