Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin1P35438 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin1P35438 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grin1P35438 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin1P35438 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin1P35438 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin1P35438 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin1P35438 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin1P35438 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms