Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Grin2aP35436 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2aP35436 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2aP35436 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
Grin2aP35436 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Grin2aP35436 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Grin2aP35436 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Grin2aP35436 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Grin2aP35436 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Grin2aP35436 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms