Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ptk2P34152 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms