Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RxraP28700 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RxraP28700 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RxraP28700 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RxraP28700 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RxraP28700 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RxraP28700 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RxraP28700 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RxraP28700 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RxraP28700 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RxraP28700 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RxraP28700 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RxraP28700 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RxraP28700 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RxraP28700 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RxraP28700 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RxraP28700 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RxraP28700 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RxraP28700 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RxraP28700 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RxraP28700 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RxraP28700 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RxraP28700 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RxraP28700 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RxraP28700 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RxraP28700 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RxraP28700 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RxraP28700 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RxraP28700 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RxraP28700 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RxraP28700 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RxraP28700 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RxraP28700 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RxraP28700 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RxraP28700 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RxraP28700 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RxraP28700 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RxraP28700 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RxraP28700 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RxraP28700 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RxraP28700 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RxraP28700 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RxraP28700 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RxraP28700 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RxraP28700 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RxraP28700 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RxraP28700 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RxraP28700 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RxraP28700 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RxraP28700 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RxraP28700 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxraP28700 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxraP28700 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxraP28700 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxraP28700 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxraP28700 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxraP28700 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxraP28700 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms