Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col2a1P28481 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col2a1P28481 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col2a1P28481 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms