Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav1P27870 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav1P27870 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav1P27870 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav1P27870 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav1P27870 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav1P27870 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav1P27870 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav1P27870 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav1P27870 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav1P27870 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav1P27870 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vav1P27870 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vav1P27870 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vav1P27870 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vav1P27870 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vav1P27870 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vav1P27870 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vav1P27870 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vav1P27870 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vav1P27870 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vav1P27870 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vav1P27870 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vav1P27870 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vav1P27870 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vav1P27870 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vav1P27870 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vav1P27870 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vav1P27870 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vav1P27870 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vav1P27870 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vav1P27870 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vav1P27870 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vav1P27870 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vav1P27870 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Vav1P27870 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vav1P27870 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vav1P27870 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vav1P27870 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav1P27870 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms