Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpbP27790 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpbP27790 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CenpbP27790 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CenpbP27790 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpbP27790 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpbP27790 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpbP27790 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpbP27790 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpbP27790 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpbP27790 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CenpbP27790 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms