Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SnrpbP27048 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms