Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CftrP26361 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CftrP26361 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CftrP26361 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CftrP26361 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CftrP26361 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CftrP26361 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CftrP26361 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CftrP26361 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CftrP26361 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CftrP26361 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CftrP26361 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CftrP26361 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CftrP26361 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CftrP26361 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CftrP26361 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CftrP26361 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CftrP26361 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CftrP26361 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CftrP26361 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CftrP26361 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CftrP26361 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CftrP26361 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CftrP26361 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CftrP26361 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CftrP26361 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CftrP26361 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CftrP26361 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CftrP26361 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CftrP26361 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CftrP26361 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CftrP26361 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CftrP26361 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CftrP26361 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CftrP26361 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CftrP26361 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CftrP26361 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CftrP26361 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CftrP26361 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CftrP26361 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CftrP26361 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CftrP26361 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CftrP26361 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CftrP26361 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CftrP26361 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CftrP26361 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CftrP26361 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CftrP26361 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CftrP26361 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CftrP26361 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CftrP26361 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CftrP26361 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CftrP26361 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CftrP26361 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CftrP26361 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CftrP26361 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CftrP26361 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CftrP26361 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CftrP26361 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CftrP26361 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CftrP26361 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CftrP26361 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CftrP26361 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
CftrP26361 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
CftrP26361 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CftrP26361 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CftrP26361 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CftrP26361 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CftrP26361 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CftrP26361 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CftrP26361 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CftrP26361 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CftrP26361 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CftrP26361 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CftrP26361 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CftrP26361 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CftrP26361 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CftrP26361 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CftrP26361 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CftrP26361 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CftrP26361 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CftrP26361 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CftrP26361 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CftrP26361 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CftrP26361 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CftrP26361 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CftrP26361 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms