Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NdnP25233 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NdnP25233 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NdnP25233 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NdnP25233 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NdnP25233 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NdnP25233 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NdnP25233 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NdnP25233 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NdnP25233 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NdnP25233 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NdnP25233 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NdnP25233 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NdnP25233 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NdnP25233 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NdnP25233 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NdnP25233 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NdnP25233 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NdnP25233 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NdnP25233 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NdnP25233 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NdnP25233 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NdnP25233 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NdnP25233 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NdnP25233 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NdnP25233 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NdnP25233 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NdnP25233 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms