Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd247P24161 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd247P24161 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd247P24161 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd247P24161 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd247P24161 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd247P24161 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd247P24161 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd247P24161 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms