Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd12P23812 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms