Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsta3P23591 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsta3P23591 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsta3P23591 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsta3P23591 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsta3P23591 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsta3P23591 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsta3P23591 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsta3P23591 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsta3P23591 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms