Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SagP20443 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SagP20443 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SagP20443 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SagP20443 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SagP20443 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SagP20443 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SagP20443 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SagP20443 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SagP20443 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SagP20443 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SagP20443 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SagP20443 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SagP20443 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SagP20443 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SagP20443 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SagP20443 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SagP20443 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SagP20443 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SagP20443 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SagP20443 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SagP20443 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SagP20443 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SagP20443 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SagP20443 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SagP20443 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SagP20443 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SagP20443 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SagP20443 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SagP20443 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SagP20443 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SagP20443 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SagP20443 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SagP20443 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SagP20443 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SagP20443 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SagP20443 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SagP20443 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SagP20443 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SagP20443 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SagP20443 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SagP20443 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SagP20443 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SagP20443 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SagP20443 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SagP20443 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SagP20443 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SagP20443 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SagP20443 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SagP20443 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SagP20443 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SagP20443 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SagP20443 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SagP20443 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SagP20443 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SagP20443 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SagP20443 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SagP20443 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SagP20443 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SagP20443 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SagP20443 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SagP20443 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SagP20443 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SagP20443 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SagP20443 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SagP20443 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SagP20443 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SagP20443 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SagP20443 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SagP20443 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SagP20443 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SagP20443 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SagP20443 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SagP20443 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SagP20443 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SagP20443 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SagP20443 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SagP20443 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SagP20443 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SagP20443 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SagP20443 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SagP20443 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SagP20443 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SagP20443 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SagP20443 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms