Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rps6ka1P18653 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms