Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms