Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ass1P16460 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ass1P16460 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ass1P16460 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ass1P16460 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ass1P16460 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ass1P16460 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ass1P16460 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ass1P16460 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ass1P16460 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ass1P16460 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ass1P16460 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ass1P16460 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ass1P16460 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms