Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rag1P15919 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rag1P15919 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rag1P15919 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rag1P15919 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rag1P15919 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rag1P15919 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rag1P15919 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rag1P15919 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms