Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54P14576 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54P14576 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54P14576 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54P14576 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54P14576 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54P14576 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54P14576 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54P14576 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54P14576 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54P14576 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp54P14576 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp54P14576 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms