Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl1P12850 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl1P12850 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl1P12850 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms