Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr4a1P12813 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a1P12813 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms