Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamp1P11438 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamp1P11438 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms