Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp1P11103 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp1P11103 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp1P11103 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp1P11103 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp1P11103 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp1P11103 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Parp1P11103 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Parp1P11103 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Parp1P11103 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Parp1P11103 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Parp1P11103 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Parp1P11103 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Parp1P11103 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms